Digital Information of Disease-specific iPS cells
DiiPS（Digital Information of iPS Cells）は、疾患特異的 iPS 細胞を分化傾向に基づいて評価・比較することができるデータベースです。パターニング培養をはじめとするオミックス解析結果に基づき、各疾患特異的 iPS 細胞がどのような分化傾向を持つのかが示されています。このデータベースに掲載されている iPS 細胞は、理化学研究所バイオリソース研究センター細胞バンクから入手可能です。
本研究は、AMED の課題番号 JP24bm1423010 の支援を受けました。
解析の一覧（3）
MPC scRNASeq healthy 12 lines
プロジェクトMPC
解析方法6モジュール解析
マイクロパターン培養由来健常12のiPS細胞株のシングルセルRNA-seqデータを、4.472遺伝子に基づく細胞状態モジュールとして要約したプロファイル
MPC scRNASeq ALS/healthy 63 lines
プロジェクトMPC
解析方法6モジュール解析
マイクロパターン培養由来ALS/健常63のiPS細胞株のシングルセルRNA-seqデータを、4,472遺伝子に基づく細胞状態モジュールとして要約したプロファイル
Motor neuron differentiation (day0,6,10,20) ALS/healthy 65 cell lines
プロジェクトAMED-PRIME
解析方法Seurat v5& 4 module解析
ALS/健常iPS細胞株65株の運動神経細胞誘導を行い、0,6,10, 20日目のシングルセルRNA-seq結果をクラスタリング、可視化し、さらに4つの細胞状態モジュール(ALSまたは健常で偏った細胞集団の存在量で定義)として要約したプロファイル